Glavne vrste: uključuju bigvanide, alkohole, fenole, organske amine, piridine, izotiazolinone i druge.
Karakteristike: Pokazuju brzo baktericidno djelovanje; međutim, posjeduju relativno slabu toplinsku stabilnost i trajnost, te mogu izazvati određene štetne nuspojave. Lako se vežu za anionska mjesta na površini staničnih membrana bakterija i plijesni ili reagiraju sa sulfhidrilnim skupinama, ometajući tako sintezu proteina i sustav stanične membrane, što učinkovito inhibira proliferaciju bakterija i plijesni. Unatoč tome, skloni su raspadanju pod utjecajem ultraljubičastog svjetla, što rezultira kratkim vijekom trajanja; nadalje, neka organska antimikrobna sredstva mogu izazvati toksične nuspojave.
Primjene: Trenutno najviše istražena i korištena organska površinski{0}}aktivna antimikrobna sredstva su kationski spojevi-koji sadrže dušik-kao što su kvaterne amonijeve soli-koje su opsežno primijenjene u antimikrobnim premazima.
